La historia de nuestra institución se remonta a 1967, cuando un grupo de entusiastas ocotlenses formó el Club Ocotlán–Cuitzeo de Exploración, con el propósito de localizar y rescatar el patrimonio arqueológico en la ribera del Lago de Chapala. Su pasión por la historia pronto los llevó a compartir sus hallazgos con la comunidad, dando origen a una galería permanente. Así nació la Asociación Civil Museo Local de Ocotlán, pionera en la preservación cultural de la región.

Entre sus fundadores destacó José María Angulo Sepúlveda, quien logró entrevistarse con el entonces presidente de la República, Luis Echeverría Álvarez. Gracias a su gestión, el grupo obtuvo el respaldo del INAH para registrar oficialmente el patrimonio arqueológico y, posteriormente, la autorización para abrir el Museo de Historia de Ocotlán, que inauguró sus puertas el 15 de abril de 1975.

En 1980, la organización recibió en donación el inmueble que ocupaba la antigua Casa de la Cultura, el cual desde entonces alberga la sede del Museo de Historia de Ocotlán y del propio patronato, edificio que fue inaugurado el 10 de octubre de 1982 por el Gobernador de Jalisco Flavio Romero de Velasco.